Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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