Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr29B1ARI9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms