Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms