Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm6880A3KG45 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6880A3KG45 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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