Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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