Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel3A2AHA7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms