Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms