Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms