Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcniQ9Z2V9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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