Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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