Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3Q9Z2D8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms