Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Syngr4Q9Z1L2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms