Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms