Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms