Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ercc4Q9QZD4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ercc4Q9QZD4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ercc4Q9QZD4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ercc4Q9QZD4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ercc4Q9QZD4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ercc4Q9QZD4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ercc4Q9QZD4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms