Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Kcnip3Q9QXT8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms