Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms