Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nectin3Q9JLB9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin3Q9JLB9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms