Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4bQ9D8B3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4bQ9D8B3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms