Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Chp2Q9D869 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chp2Q9D869 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms