Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp5Q9D7S9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp5Q9D7S9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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