Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nip7Q9CXK8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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