Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc2Q9CX47 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms