Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CWU4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9CWU4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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