Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms