Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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