Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms