Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms