Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms