Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms