Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krt88Q9CPR6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krt88Q9CPR6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms