Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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