Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp1b4Q99ME6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms