Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lactb2Q99KR3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms