Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms