Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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TrabdQ99JY4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TrabdQ99JY4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms