Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctu1Q99J10 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctu1Q99J10 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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