Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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