Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Dnajc28Q8VCE1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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