Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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