Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lin28aQ8K3Y3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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