Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vrk3Q8K3G5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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