Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc12Q8K2L8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc12Q8K2L8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms