Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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