Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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