Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nsun3Q8CCT7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nsun3Q8CCT7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms