Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nhlrc3Q8CCH2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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