Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp20Q8C6M1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp20Q8C6M1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp20Q8C6M1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp20Q8C6M1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp20Q8C6M1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp20Q8C6M1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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