Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc21aQ8C0S4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms