Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms